Threema wurde von Threema GmbH entwickelt, einem in der Schweiz ansässigen Unternehmen mit Sitz in Zürich. Der Gründer und Geschäftsführer ist Florian Kneisel. Das Unternehmen wurde 2012 gegründet und ist bekannt für seine Fokus auf Datenschutz und Sicherheit, wobei alle Server in der Schweiz betrieben werden und der Quellcode teilweise überprüfbar ist.